(左起)段鑫先生、林旭東博士、史鵬博士、鄭淑嫻教授、王鑫博士。
香港城市大學(xué)(城大)領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊成功開辟快捷途徑,能夠在多不勝數(shù)的化合物中,篩選出潛力高的進(jìn)行研發(fā),從而減少研制新藥的時間及成本,準(zhǔn)確度約50%。
城大生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)系和生物醫(yī)學(xué)系,聯(lián)同美國哈佛醫(yī)學(xué)院的科研團(tuán)隊,歷經(jīng)五年合作研究,在神經(jīng)藥理學(xué)方面取得突破。研究結(jié)果在科學(xué)期刊《自然通訊》發(fā)表,題為「以高通量大腦活動圖譜和機(jī)器學(xué)習(xí)為基礎(chǔ)的系統(tǒng)神經(jīng)藥理學(xué)研究」。
研究由城大生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)系副教授史鵬博士領(lǐng)導(dǎo),旨在提供一個技術(shù)平臺以預(yù)測化合物是否有潛力研發(fā)成治療大腦疾病的新藥。該平臺有助加快發(fā)現(xiàn)新藥的過程,節(jié)省成本。
史博士說:「即使藥物研發(fā)的成功率僅提高1%,對中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病患者而言,足以帶來重大改變!
這項研究以小型脊椎動物——斑馬魚作為研究對象,對牠們整個腦部進(jìn)行掃描和追蹤神經(jīng)細(xì)胞的活動,以顯示其大腦或中樞神經(jīng)系統(tǒng)對藥物的反應(yīng)。這個藥物篩選系統(tǒng)運用創(chuàng)新方法簡化流程,因而能進(jìn)行大規(guī)模實驗。
史博士解釋說︰「我們運用機(jī)械人、微流控技術(shù)與水動力,可于20秒內(nèi)自動捕獲并固定一條未經(jīng)麻醉的斑馬魚,而過往要花上20分鐘,因此可同時對多條斑馬魚進(jìn)行掃描;更重要的是,我們的技術(shù)毋須用麻醉藥來降低斑馬魚的運動功能,因此避免了干擾。」
大腦活動圖譜示例,用于預(yù)測化合物的神經(jīng)藥理學(xué)性質(zhì)。
研究團(tuán)隊首先為179種現(xiàn)有中樞神經(jīng)系統(tǒng)藥物建立大腦活動圖譜的參考庫。他們對數(shù)以千計的斑馬魚分別逐一施加一種臨床中樞神經(jīng)系統(tǒng)藥物,相關(guān)的大腦活動圖譜顯示斑馬魚腦部不同區(qū)域?qū)@些藥物的反應(yīng)情況。然后,研究團(tuán)隊根據(jù)圖譜之間的內(nèi)在相似性,運用機(jī)器學(xué)習(xí)算法將這些藥物按斑馬魚大腦生理表現(xiàn)分類為10個集群。
建立參考庫之后,研究團(tuán)隊與城大生物醫(yī)學(xué)系助理教授王鑫博士、哈佛醫(yī)學(xué)院副教授Stephen Haggarty博士緊密合作,進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,運用機(jī)器學(xué)習(xí)算法來預(yù)測121種新型化合物的潛在臨床治療功效。
機(jī)器學(xué)習(xí)策略預(yù)測到在121種新化合物中,有30種具抗癲癇特性。為了驗證這個預(yù)測,研究團(tuán)隊從這30種潛在抗癲癇化合物中,隨機(jī)挑選了14種,在斑馬魚的癲癇動物模型作行為學(xué)測試。
結(jié)果顯示,14種化合物中有7種能夠減輕斑馬魚癲癇發(fā)作,而不會產(chǎn)生任何鎮(zhèn)定性副作用,顯示預(yù)測的準(zhǔn)確度達(dá)到50%左右。史博士說:「結(jié)合快速的體內(nèi)藥物篩選系統(tǒng)和機(jī)器學(xué)習(xí),我們?yōu)閰f(xié)助篩選出更具治療藥用潛力的新型化合物提供快捷方式,從而加快藥物研發(fā),降低整個過程中的失敗比率!
該論文的共同第一作者是生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)系副研究員林旭東博士、生物醫(yī)學(xué)系副研究員段鑫先生,其他作者包括生物醫(yī)學(xué)系鄭淑嫻教授、生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)系畢業(yè)生陳中原先生和前副研究員陳思亞女士。
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